More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7274 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7274  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7162  LysR family transcriptional regulator  52.81 
 
 		 317 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7486  LysR family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 309 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7271  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1836  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.14 
 
 		 313 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.988873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  32.54 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 317 aa  162  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 297 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2319  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 345 aa  158  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 298 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 298 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  32.39 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.65 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  31.88 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0011  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 296 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 314 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6247  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 325 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249032  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  30.61 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 296 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 327 aa  139  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4035  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  31.27 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6198  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0517746 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  27.87 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0686  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>