More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2910 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2910  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 312 aa  621  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3769  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.283182  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4274  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6414  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.773226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  40.7 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  35.47 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  38.64 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  36.53 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  35.45 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.36 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1124  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  36.11 
 
 		 294 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 301 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 297 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 		 301 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  39.18 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  39.21 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  36.88 
 
 		 317 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  35.19 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6962  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2733  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0391194 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 296 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 321 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 297 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  36.88 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 294 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.88 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>