More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0521 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0521  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1581  LysR family transcriptional regulator  99.38 
 
 		 325 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0832  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1743  LysR family transcriptional regulator  98.77 
 
 		 325 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1353  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0634  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0961605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1555  LysR family transcriptional regulator  98.77 
 
 		 325 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.729092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3346  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0975  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2509  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123879  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0835  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 364 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.643048  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1466  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5102  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3664  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  34.19 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1556  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00011369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1817  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  30.2 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1911  transcriptional regulator, LysR family  29.87 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0712  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1039  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.204243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05499  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 307 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3393  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1321  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.428076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001561  transcriptional regulator LysR family  28.95 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17090  Transcriptional regulator, LysR family  39.6 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0879  transcriptional regulator, LysR-family  27.57 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3181  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6140  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6428  LysR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.410616 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4012  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2547  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2671  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.21 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2130  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  27.24 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.809904  hitchhiker  0.00950877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0713  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4404  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0798  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.748427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.65 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6811  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.35 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.35 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.35 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.35 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  28.42 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.35 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000907778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.35 
 
 		 302 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1512  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 300 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.35 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  29.35 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 305 aa  99.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 300 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  31.25 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2608  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 300 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 297 aa  99.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 305 aa  99.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 305 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 307 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1784  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 308 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4814  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3737  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 299 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.52 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  29.43 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  35.1 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  29.43 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>