More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5460 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5460  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 323 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3242  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.783996  normal  0.606563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1033  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 305 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0449  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.206792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1856  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397268  normal  0.189017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0243  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1346  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4431  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203311  normal  0.0207668 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0362  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1241  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54710  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0282629  hitchhiker  0.000000212849 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3932  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02390  putative transcriptional regulator  23.93 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.125777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2377  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0334  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.937617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3722  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0323  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.712215  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2378  transcriptional regulator, LysR family  38.81 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.550059  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  27.96 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2844  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1177  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1878  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  27.96 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4014  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993243 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  39.16 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1724  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0891  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2155  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0367  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2796  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000015017  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0275  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  25.58 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1798  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3422  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2079  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  30.89 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5902  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0290  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000353581  unclonable  0.0000000000404999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0270  putative transcriptional regulator  24.1 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  30.89 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3409  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000205674  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6279  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.853618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1368  LysR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0370  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.825103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2527  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5136  LysR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4781  putative transcriptional regulator  33.51 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0229  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00000000369009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  25 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0187  transcriptional regulator, LysR family  33.5 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.502015  normal  0.832957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2398  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0237  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000618389  unclonable  0.0000000000250683 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  30.57 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  26.74 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4060  hypothetical protein  30 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0282036  normal  0.215669 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2950  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.954303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2167  transcriptional regulator, LysR family  40.62 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3484  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.03 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.875325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3717  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.168673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2140  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.828195  normal  0.0106328 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2478  LysR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1867  LysR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  32.07 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3368  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.93 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.578087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5810  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2503  LysR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0552  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000594224  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4576  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1664  LysR substrate-binding protein  32.14 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1305  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000111615  normal  0.494502 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4604  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0594  putative transcriptional regulator  33.14 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5027  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2527  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4881  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0221  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8676  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  23.08 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0817  transcriptional activator protein MetR  28.37 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>