More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2527 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2527  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  646    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000621  transcriptional regulator  39.31 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2379  transcriptional regulator of LysR family protein  52.34 
 
 		 131 aa  142  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6795  transcriptional regulator, LysR family  26.57 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.775917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02390  putative transcriptional regulator  25.76 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.125777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1368  LysR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3691  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4050  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 308 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0270  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7076  transcriptional regulator, LysR family  27.04 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  26.76 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5612  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5938  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.254792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0229  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4846  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5439  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5423  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0829573  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  27.37 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3429  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000037379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54710  putative transcriptional regulator  31.44 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0282629  hitchhiker  0.000000212849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0230  transcriptional regulator PcaQ  32.31 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  29.63 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 318 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4764  LysR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  29.63 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5307  LysR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0037216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6124  pca operon transcription factor PcaQ  27.14 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0261121  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.64 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  28.64 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.64 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.64 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1765  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.64 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2503  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  28.64 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0562  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260746  normal  0.122148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.64 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3724  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.64 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  27.66 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2771  LysR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  23.24 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  29.48 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5460  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.62 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.16 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4463  transcriptional regulator, LysR family  25.77 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08140  Transcriptional regulator, LysR family  27.69 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0677  putative transcriptional activator METR transcription regulator protein  27.1 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0439978  normal  0.107972 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2959  LysR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4154  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3348  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0103811 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3914  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4012  putative LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6089  transcriptional regulator, LysR family  25.2 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  22.9 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  29.79 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  30.62 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2774  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1440  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  27.5 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.32 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547513  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4781  putative transcriptional regulator  30.17 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1900  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  26.7 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9122  transcriptional regulator LysR family  34.15 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272259  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1982  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7451  LysR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2486  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3174  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3489  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1007  fhu operon transcription regulator  30.57 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000456933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0691  LysR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.780494  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6759  transcriptional regulator, LysR family  29.38 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.405841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4130  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.09 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.717557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>