More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6089 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6089  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 299 aa  614  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.631201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 326 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  27.97 
 
 		 294 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.59 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  31.3 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0270  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.75 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.38 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0212  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.5 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  27.07 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.5 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.5 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  26.5 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.5 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.5 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  29.66 
 
 		 289 aa  96.3  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.5 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  27.99 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1919  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.18 
 
 		 299 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.96 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3323  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711414  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4600  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4789  transcriptional regulator, LysR family  27.09 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.64 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02390  putative transcriptional regulator  28.2 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.125777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 304 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  27.78 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.93 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.93 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.93 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.93 
 
 		 299 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  34.81 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5250  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.07 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3549  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  34.81 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  30.68 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4296  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4431  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203311  normal  0.0207668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4731  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  34.81 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3205  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0988994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0650  transcriptional regulator, LysR family  26.55 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.344002 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  26.72 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.64 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  26.64 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 329 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 311 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3888  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3296  StmR  34.81 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.618402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08140  Transcriptional regulator, LysR family  28.35 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2079  HTH-type transcriptional regulator  27.09 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0146  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3319  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 331 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3715  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3555  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 302 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  28.1 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  27.9 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 314 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  28.85 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0223  transcriptional regulator, LysR family  27.48 
 
 		 308 aa  85.5  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2148  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  27.47 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1189  transcriptional regulator, LysR family  28.51 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.544335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>