More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4468 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 307 aa  315  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  48.52 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  48.71 
 
 		 361 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 347 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  48.71 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 342 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 342 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 317 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  38.49 
 
 		 363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 303 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 316 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 321 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 291 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 298 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 324 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  34.91 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 297 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3293  transcriptional regulator, LysR family  34.88 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 304 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4814  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  31.39 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 296 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  28.96 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2150  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.84 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.651941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2259  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3151  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2124  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  29.51 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.797631  normal  0.149196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0080  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4978  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0960  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 295 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  29.11 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5155  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3619  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  27.14 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4207  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4703  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 294 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53720  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0163638  hitchhiker  0.00327626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3733  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0569  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1094  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  29.58 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.827537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4682  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16132  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4048  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4318  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.485382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2383  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  28.4 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1693  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0814  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.35587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5695  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.86 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  24.13 
 
 		 306 aa  99  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5799  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 306 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2919  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 305 aa  99  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.395037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1695  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>