More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1775 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3293  transcriptional regulator, LysR family  61.67 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 316 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 342 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 303 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 342 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 361 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  36.33 
 
 		 363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 313 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 307 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 292 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5695  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.2 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4814  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 339 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 329 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0498  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  33.2 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4978  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 327 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3151  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2882  LysR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.241105  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 305 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2004  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0114  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  25.76 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  25.09 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1136  nitrogen assimilation transcriptional regulator  29.32 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190292  hitchhiker  0.000106963 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2270  nitrogen assimilation transcriptional regulator  29.32 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000041726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1939  transcriptional regulator, LysR family  28.46 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01898  DNA-binding transcriptional dual regulator of nitrogen assimilation  29.32 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1667  transcriptional regulator, LysR family  29.32 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1657  nitrogen assimilation transcriptional regulator  29.32 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000208245  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2111  nitrogen assimilation transcriptional regulator  29.32 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.1125e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  27.68 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0970  nitrogen assimilation transcriptional regulator  29.32 
 
 		 307 aa  96.7  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243153  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01887  hypothetical protein  29.32 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0017445  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2832  nitrogen assimilation transcriptional regulator  29.32 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000572709  normal  0.465707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>