More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0927 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 348 aa  691    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  91.09 
 
 		 342 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  91.09 
 
 		 342 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  91.04 
 
 		 349 aa  590  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  92.99 
 
 		 345 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  96.28 
 
 		 347 aa  567  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  92.73 
 
 		 361 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  59.34 
 
 		 311 aa  309  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  48.71 
 
 		 315 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 303 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 303 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 303 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 317 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  43.25 
 
 		 363 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 321 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  38.29 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 316 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 297 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 307 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3293  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4814  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 312 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  30.47 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  29.6 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 318 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  31.39 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  28.97 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  28.42 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4978  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 309 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0080  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 303 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 294 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3151  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  31.32 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0960  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5155  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3943  transcriptional regulator, LysR family  30.16 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  0.897444 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4056  transcriptional regulator, LysR family  30.16 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0970  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 303 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 309 aa  99.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2150  LysR family substrate binding transcriptional regulator  27.21 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.651941  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0569  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 290 aa  96.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 308 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 308 aa  96.7  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  26.16 
 
 		 293 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2259  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 314 aa  96.3  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2423  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 320 aa  95.9  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 699 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2173  transcriptional regulator, LysR family  29.02 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2124  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  26.84 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.797631  normal  0.149196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  29.53 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 293 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6474  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.254118 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2269  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  31.53 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5027  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>