More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0204 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  684    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  73.79 
 
 		 306 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  57.81 
 
 		 298 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  44.63 
 
 		 300 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  36.2 
 
 		 332 aa  189  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1695  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 299 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0814  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.35587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2198  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1564  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0718  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0603  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2111  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2039  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5799  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0788  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 307 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2150  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.43 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.651941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2124  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  28.72 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.797631  normal  0.149196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2259  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 345 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 349 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 291 aa  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 296 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  28.31 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0960  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  25.57 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  25.1 
 
 		 296 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5155  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 303 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4480  LysR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.678379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3968  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  25.91 
 
 		 308 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3151  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 302 aa  89.4  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 307 aa  89.4  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3649  lysR-family transcriptional regulatory protein  26.35 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.533286 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4350  transcriptional regulator MetR  26.5 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0569  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 314 aa  88.6  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3953  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4193  transcriptional regulator MetR  26.46 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0114  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0262  transcriptional regulator MetR  26.35 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4290  transcriptional regulator MetR  26.18 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305049  normal  0.326803 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0400  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4171  transcriptional regulator MetR  26.18 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4243  transcriptional regulator MetR  26.18 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 303 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03707  DNA-binding transcriptional activator, homocysteine-binding  26.01 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03656  hypothetical protein  26.01 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4348  transcriptional regulator MetR  26.01 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  25.85 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 311 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>