More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2150 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2124  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  99.38 
 
 		 320 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.797631  normal  0.149196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2150  LysR family substrate binding transcriptional regulator  100 
 
 		 320 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.651941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2259  LysR family transcriptional regulator  97.5 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0814  LysR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 295 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.35587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1695  LysR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 299 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2111  LysR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 295 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1564  LysR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 295 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0603  LysR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 295 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2198  LysR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 295 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0718  LysR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 295 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2039  LysR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 295 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0788  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 334 aa  301  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5799  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 306 aa  285  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  34.12 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 332 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 291 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  28.89 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 316 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  26.39 
 
 		 316 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  27.67 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 304 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0960  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 348 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0569  LysR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 349 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 303 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 303 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 303 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1636  putative LysR substrate binding domain  27.21 
 
 		 290 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1628  putative LysR substrate binding domain  27.21 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1695  putative LysR substrate binding domain  27.21 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1812  putative LysR substrate binding domain-containing protein  27.21 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1647  putative LysR substrate binding domain  27.21 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0636291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1296  transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1720  transcriptional regulator, LysR family  29.46 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.820276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  25.08 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  27.69 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  26.07 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0861  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278142  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 294 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2348  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.09 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000261353  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2550  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.09 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2410  transcriptional regulator, LysR family  25.86 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.975942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2392  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.09 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  hitchhiker  0.00212314 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2004  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2440  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.09 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.924518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2436  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.09 
 
 		 287 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0199714 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5155  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>