More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2901 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  666    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  65.56 
 
 		 332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1564  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2111  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0603  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0718  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2039  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2198  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0814  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.35587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5799  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2150  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.19 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.651941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2259  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2124  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  29.19 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.797631  normal  0.149196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  28.89 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 291 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 316 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1695  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 349 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  25.76 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 324 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0788  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5155  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 310 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3293  transcriptional regulator, LysR family  29.18 
 
 		 301 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 311 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 318 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0498  transcriptional regulator, LysR family  23.96 
 
 		 292 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4777  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 299 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3151  transcriptional regulator  25.43 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 303 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4793  LysR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 310 aa  89.4  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 292 aa  89.4  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 297 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1068  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2063  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.656887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 297 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06400  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 699 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0594  putative transcriptional regulator  27.24 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 298 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1560  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0367  transcriptional regulator  26.64 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0275  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2155  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1878  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1724  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1177  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0891  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>