More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2111 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1564  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
295 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0603  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
295 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2039  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
295 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2198  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
295 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0718  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
295 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2111  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
295 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0814  LysR family transcriptional regulator  95.59 
 
 
295 aa  567  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.35587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1695  LysR family transcriptional regulator  80.27 
 
 
299 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0788  LysR family transcriptional regulator  61.62 
 
 
334 aa  332  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2150  LysR family substrate binding transcriptional regulator  55.67 
 
 
320 aa  308  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.651941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2124  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  55.67 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.797631  normal  0.149196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2259  LysR family transcriptional regulator  55.33 
 
 
314 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5799  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 
306 aa  265  8e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 
302 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 
306 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
339 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
300 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 
300 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 
332 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
305 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
305 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
305 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
327 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
325 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
297 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
291 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  28.17 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  29.68 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
303 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 
297 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
303 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
303 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
305 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  27.24 
 
 
316 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
303 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
321 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
310 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
310 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
303 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2588  transcriptional regulator, LysR family protein  26.56 
 
 
293 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  32.36 
 
 
295 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
316 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
304 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
324 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2246  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 
286 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
320 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  28.15 
 
 
363 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
315 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
310 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
310 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
317 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4176  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
298 aa  92.4  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.661797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3312  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.14 
 
 
317 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.404557 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0960  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234863  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  32.56 
 
 
343 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2022  LysR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4369  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 
289 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
311 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0109  transcriptional regulator, LysR family  36.09 
 
 
292 aa  89.7  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  21.4 
 
 
294 aa  89.4  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4131  transcriptional regulator, LysR family  39.2 
 
 
289 aa  89  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3823  LysR substrate-binding  38.64 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6616  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3907  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 
311 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
297 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3319  transcriptional regulator, LysR family  29.68 
 
 
284 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1720  transcriptional regulator, LysR family  32.38 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.820276  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  21.4 
 
 
294 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3618  transcriptional regulator, LysR family  30.99 
 
 
284 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3671  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 
288 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5953  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 
297 aa  85.5  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3573  hypothetical protein  30.56 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1536  LysR, substrate-binding  32.87 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0103  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2180  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000148525  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1324  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4303  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  29.46 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4974  transcriptional regulator, LysR family  32.48 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.19467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0121  transcriptional regulator, LysR family  27.86 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>