More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3815 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 361 aa  717    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  80.06 
 
 		 349 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  79.5 
 
 		 342 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  79.5 
 
 		 342 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  92.12 
 
 		 347 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  92.01 
 
 		 345 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  80.11 
 
 		 348 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 311 aa  296  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  48.71 
 
 		 315 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 303 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  43.94 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 303 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 296 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 324 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  38.29 
 
 		 297 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 297 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 320 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 298 aa  182  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 297 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 304 aa  166  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3293  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 301 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4814  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  32.47 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4978  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  33.85 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0080  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 292 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3151  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0970  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 297 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2150  LysR family substrate binding transcriptional regulator  27.57 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.651941  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3943  transcriptional regulator, LysR family  31.3 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  0.897444 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4056  transcriptional regulator, LysR family  31.3 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2259  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 314 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2777  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2124  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  27.21 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.797631  normal  0.149196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2742  putative transcriptional regulator  31.42 
 
 		 292 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6028  transcriptional regulator, LysR family  31.95 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  32.08 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0960  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2263  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  29.13 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  29.13 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2269  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 303 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0569  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 314 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 306 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  25.19 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6474  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 327 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.254118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  26.07 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  27.08 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>