More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0080 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0080  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
303 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
292 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
297 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  28.1 
 
 
297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
291 aa  116  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 
316 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
320 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
315 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
315 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
348 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
307 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
345 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
342 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
342 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
361 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
347 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
316 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
349 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  28.2 
 
 
314 aa  95.9  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
298 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  25.8 
 
 
303 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 
303 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 
303 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
311 aa  89  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3151  transcriptional regulator  26 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117197  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  27.63 
 
 
363 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  24.05 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  24.05 
 
 
296 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 
311 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
317 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  23.59 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  23.73 
 
 
299 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  23.67 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  26.16 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3293  transcriptional regulator, LysR family  25.61 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  26.42 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  23.61 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  25.74 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2957  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.549224  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  32.92 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1513  transcriptional regulator, LysR family  26.44 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3253  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
342 aa  72.4  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2781  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  31.41 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  25.51 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1936  transcriptional regulator, LysR family  25.42 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4227  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  32.48 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3406  transcriptional regulator, LysR family  25.58 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2036  transcriptional regulator, LysR family  24.86 
 
 
262 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39512  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0714  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2015  LysR family transcriptional regulator  24.86 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.253751  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0498  transcriptional regulator, LysR family  23.31 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1827  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.140863  hitchhiker  0.00393629 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0727  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  27.03 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5162  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4134  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3382  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4785  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3317  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.176434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1719  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
332 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1749  LysR family transcriptional regulator  23 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.136733  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2821  LysR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5203  LysR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715781  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5247  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8569  transcriptional regulator, LysR family  26.56 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>