More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5126 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  95.16 
 
 		 310 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  95.16 
 
 		 310 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  95.16 
 
 		 310 aa  567  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  94.52 
 
 		 310 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  94.19 
 
 		 310 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  82.26 
 
 		 310 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4814  transcriptional regulator, LysR family  55.48 
 
 		 312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4978  LysR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 313 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 361 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 303 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  36.19 
 
 		 363 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 342 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  37.21 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3293  transcriptional regulator, LysR family  35.32 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3151  transcriptional regulator  32.23 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5799  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  27.41 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0814  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.35587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  30.26 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  27.09 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1564  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2039  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2198  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0603  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2111  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0718  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6040  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.061034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  38.73 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2361  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 287 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5676  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  28.48 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  38.73 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2150  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.87 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.651941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2124  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  28.87 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.797631  normal  0.149196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3560  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1695  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2214  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  28.53 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  28.83 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3423  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0017  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.163482 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2259  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6172  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442907  normal  0.0562293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3671  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 288 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3882  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 284 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2980  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0695506  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  28.1 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6263  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3396  LysR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3081  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 293 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.294093  normal  0.575157 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7727  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  28.36 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>