More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2980 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2980  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0695506  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  92.28 
 
 		 301 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1845  LysR family transcriptional regulator  76.55 
 
 		 303 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102688 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7727  LysR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 298 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  40.52 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3983  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 285 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2962  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.710612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 287 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2019  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1974  transcriptional regulator, LysR family  40.46 
 
 		 281 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601585  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4649  transcriptional activator  38.52 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 284 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  36.09 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 283 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 283 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1129  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3244  transcriptional regulator, LysR family  37.74 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386133  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 283 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1220  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.286254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  37.22 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1168  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 294 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0106  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2354  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 295 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  37.91 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2833  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000597917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.624518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 288 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2346  transcriptional regulator, LysR family  35.45 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 292 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12140  putative transcriptional regulator  36.47 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3396  LysR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2469  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.23 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000182505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2777  putative transcriptional regulator  35.93 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2514  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.23 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00051335  normal  0.704874 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2676  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.23 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.784227 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2558  HTH-type transcriptional regulator PecT  36.23 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000175067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  34.38 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1911  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 283 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 317 aa  138  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  34.83 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2043  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0201239 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4056  transcriptional regulator, LysR family  36.98 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3943  transcriptional regulator, LysR family  36.98 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  0.897444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2569  HTH-type transcriptional regulator PecT  35.87 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00146874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2773  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4590  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1817  LysR-family transcriptional regulatory protein  34.59 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5676  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  34.59 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6040  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.061034 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1393  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2444  transcriptional regulator LrhA  35.58 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 286 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0961  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 289 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02174  hypothetical protein  35.58 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1363  LysR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>