More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7727 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7727  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  593  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1845  LysR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 303 aa  325  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2980  LysR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0695506  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  56.55 
 
 		 301 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2962  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.710612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3983  transcriptional regulator, LysR family  35.46 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4649  transcriptional activator  39.72 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1974  transcriptional regulator, LysR family  41.06 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601585  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2019  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  36.71 
 
 		 287 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3244  transcriptional regulator, LysR family  36.8 
 
 		 280 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386133  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  37.41 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  37.39 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0804  LysR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  37.3 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2346  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0106  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 323 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3916  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0255667  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5676  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6040  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.061034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  32.76 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 293 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4400  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 311 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1168  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4357  transcriptional regulator, LysR family  36.48 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  32.37 
 
 		 295 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0683  LysR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5843  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  34.72 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5384  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.99 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.629114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2354  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0718  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.235527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  34.13 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5304  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 289 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 284 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5203  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  32.71 
 
 		 294 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3885  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 315 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  33.91 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1431  LysR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0243  LysR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  32.33 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3317  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.176434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0242  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546914  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5162  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2662  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2821  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4134  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4785  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3382  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  32.69 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3803  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4056  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3943  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  0.897444 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 311 aa  118  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3591  LysR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449761 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0160  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3319  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.624518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>