More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3983 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3983  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 285 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2019  LysR family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 285 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  36.29 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2980  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0695506  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1845  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102688 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7727  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  33.72 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4236  transcriptional regulator  32.01 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.999782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49640  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 300 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.097129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5676  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6040  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.061034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0717  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 313 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2962  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 291 aa  138  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.710612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1683  LysR substrate-binding  31.43 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.95 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2002  transcriptional regulator, LysR family  31.43 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2346  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  33.86 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3053  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 306 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3534  LysR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2239  LysR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1974  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601585  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2390  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2773  transcriptional regulator, LysR family  32.46 
 
 		 316 aa  132  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  31.23 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2586  transcriptional regulator LysR family  28 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4827  transcriptional regulator, LysR family  32.13 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2757  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5203  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4219  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2821  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  30.22 
 
 		 293 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 290 aa  128  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1278  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2833  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 312 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000597917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2125  HTH-type transcriptional regulator  29.86 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1911  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3317  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.176434 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5162  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3396  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4134  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1491  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 289 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4785  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3382  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02214  DNA-binding transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes  32.02 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2582  transcriptional regulator LrhA  32.02 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.210285  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2444  transcriptional regulator LrhA  32.02 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2438  transcriptional regulator LrhA  32.02 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.340717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02174  hypothetical protein  32.02 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2665  transcriptional regulator LrhA  32.02 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0194806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1363  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3428  transcriptional regulator LrhA  32.02 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0286077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2839  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0095  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 291 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1367  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 312 aa  125  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.189941  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2551  transcriptional regulator, LysR family  32.46 
 
 		 311 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4190  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0252504  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5787  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6152  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4590  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 318 aa  125  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2777  putative transcriptional regulator  30.97 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1020  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  30.68 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1817  LysR-family transcriptional regulatory protein  30.68 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2647  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1467  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4649  transcriptional activator  29.93 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6632  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1393  transcriptional regulator, LysR family  32.02 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3176  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1230  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 284 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3591  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2383  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>