More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4190 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4190  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0252504  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21400  Transcriptional regulator, LysR family  43.37 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3309  LysR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2551  transcriptional regulator, LysR family  43.97 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405251  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1393  transcriptional regulator, LysR family  43.58 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00391228  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1452  transcriptional regulator LrhA  47.47 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1817  LysR-family transcriptional regulatory protein  47.47 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2043  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 301 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0201239 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4138  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3972  transcriptional regulator, LysR family  44.02 
 
 		 290 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.539767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2626  transcriptional regulator, LysR family  42.6 
 
 		 290 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.117522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2773  transcriptional regulator, LysR family  41.42 
 
 		 316 aa  219  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.785949  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1129  transcriptional regulator, LysR family  43.63 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1220  transcriptional regulator, LysR family  43.63 
 
 		 289 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.286254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1491  transcriptional regulator, LysR family  41.79 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02214  DNA-binding transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes  43.87 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1367  transcriptional regulator, LysR family  43.87 
 
 		 312 aa  215  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.189941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1363  LysR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02174  hypothetical protein  43.87 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2665  transcriptional regulator LrhA  43.87 
 
 		 312 aa  215  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0194806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2438  transcriptional regulator LrhA  43.87 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.340717  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2582  transcriptional regulator LrhA  43.87 
 
 		 312 aa  215  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.210285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2444  transcriptional regulator LrhA  43.87 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3428  transcriptional regulator LrhA  43.87 
 
 		 312 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0286077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2833  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000597917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0274  LysR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2676  HTH-type transcriptional regulator PecT  43.66 
 
 		 312 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.784227 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2469  HTH-type transcriptional regulator PecT  43.66 
 
 		 312 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000182505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2514  HTH-type transcriptional regulator PecT  43.66 
 
 		 312 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00051335  normal  0.704874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2558  HTH-type transcriptional regulator PecT  43.66 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000175067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2569  HTH-type transcriptional regulator PecT  43.28 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00146874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3930  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.983373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 295 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  36.46 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.28 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  37.23 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  34.48 
 
 		 332 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2512  LysR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 296 aa  142  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1770  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103333  normal  0.0253433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2383  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1168  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0607  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3593  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6042  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.957083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2857  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 348 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.18 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3585  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0651173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4068  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2994  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2656  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1431  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4400  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2019  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4883  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0425  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00857  putative regulatory protein LysR Family  30.83 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.977241  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4490  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0160  transcriptional regulator, LysR family  33.93 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  35.32 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>