More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2365 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2365  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  621  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3458  LysR family transcriptional regulator  83.87 
 
 		 310 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5281  LysR family transcriptional regulator  83.87 
 
 		 310 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2577  LysR family transcriptional regulator  83.87 
 
 		 310 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571324  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3970  LysR family transcriptional regulator  82.9 
 
 		 310 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0573169 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5126  LysR family transcriptional regulator  82.26 
 
 		 310 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0428454 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3549  LysR family transcriptional regulator  82.58 
 
 		 310 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4814  transcriptional regulator, LysR family  54.34 
 
 		 312 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4978  LysR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4745  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.729487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 363 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 347 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 361 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 342 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 342 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0474  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3293  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 296 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5799  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3151  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  27.41 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  27.09 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  26.14 
 
 		 299 aa  99.4  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1564  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0603  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2111  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0718  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2039  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2198  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6263  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1695  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0814  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 295 aa  95.9  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.35587  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3423  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  27.51 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5676  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6040  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.061034 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3436  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3081  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.294093  normal  0.575157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 300 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 327 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6172  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.442907  normal  0.0562293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2980  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0695506  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7471  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  26.35 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  27.31 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2061  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  0.159895 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  31.98 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7727  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2361  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 287 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3560  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  28.52 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1448  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0273001  normal  0.589236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2214  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0114  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  25.99 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0282  hypothetical protein  27.55 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3812  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>