More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3891 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3891  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.132364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2486  LysR family transcriptional regulator  95.24 
 
 		 296 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5135  LysR family transcriptional regulator  63.23 
 
 		 296 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5310  LysR family transcriptional regulator  61.49 
 
 		 296 aa  332  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5943  LysR family transcriptional regulator  58.5 
 
 		 305 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.180862 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5902  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1919  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.88 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  33.66 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2373  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0629728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.23 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0720  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  31.89 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1029  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.850278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3116  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 304 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  30.6 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 314 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1848  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 351 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5051  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443716  normal  0.966436 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  34.43 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1890  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.45 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.77 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  28.77 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  28.77 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3368  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.93 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.578087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.11 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.11 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 414 aa  105  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.11 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  29.68 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1501  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.11 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0095  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.37 
 
 		 411 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  32.09 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4119  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 392 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0094  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  29.04 
 
 		 411 aa  102  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2649  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2156  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  37.55 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2180  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.56 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1974  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3156  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  33.02 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0837  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.033112  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.38 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2857  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  28.22 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3681  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2832  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 419 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>