More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5310 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5310  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5135  LysR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 296 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2486  LysR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 296 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3891  LysR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 305 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.132364 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5943  LysR family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.180862 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5902  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.64 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0720  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3116  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  30.64 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1029  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.850278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2373  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0629728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1919  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.75 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 308 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 406 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1848  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7100  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 419 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  33.09 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 351 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0198  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  30.26 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32700  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0685887  hitchhiker  0.0000452911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3368  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.04 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.578087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2120  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.184045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 338 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  28.18 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3574  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3299  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0793122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  34.18 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1225  LysR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1974  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2294  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 318 aa  99.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2061  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3375  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.253133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  30.13 
 
 		 314 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  30.57 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5134  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  0.868057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2084  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859391  normal  0.308177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4144  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11543  normal  0.0506604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0594  putative transcriptional regulator  34.18 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4222  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.638032  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 417 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3624  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3178  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  34.2 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2479  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0345  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0092  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0644  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0772357  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 325 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1794  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 301 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3319  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 298 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2023  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2539  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1168  oxidative stress regulatory protein OxyR  31.63 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 339 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>