More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5134 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5134  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  680    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  0.868057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 316 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3819  LysR family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.37605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3205  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 317 aa  228  8e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0988994 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0068  transcriptional regulator, LysR family  41.14 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6018  LysR family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5141  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.730925 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6318  LysR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0795  LysR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.556779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26270  putative transcriptional regulator  43.03 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.338283  normal  0.903696 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2599  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6961  transcriptional regulator, LysR family  39.75 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7090  transcriptional regulator, LysR family  37.05 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1765  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0207  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4197  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2168  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2711  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 300 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 300 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2585  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0206  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0296  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5758  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0665563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3822  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4546  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1940  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 300 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1663  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 338 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 300 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1244  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 300 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0957  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 300 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2219  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 300 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0218  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3555  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0146  transcriptional regulator, LysR family  37.85 
 
 		 296 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1301  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 301 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.828365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.21 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.21 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.2 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.38 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.38 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  32.38 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0793  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1495  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1807  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.38 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0475  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0377  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.38 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.38 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2110  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.79 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6670  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 311 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5936  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4846  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5423  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0829573  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5439  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5307  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0037216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0229  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4764  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.62 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5417  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.826157  normal  0.396347 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7451  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0947  LysR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3348  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0103811 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5895  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0445545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1450  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.756367  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1408  transcriptional regulator, LysR family  34.84 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0263821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3287  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0254  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.56957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3565  DNA-binding transcriptional activator TdcA  28.93 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4768  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5515  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3599  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  27.61 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5372  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4898  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2994  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4296  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4505  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3239  DNA-binding transcriptional activator TdcA  26.64 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  33.33 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02985  DNA-binding transcriptional activator  26.2 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3592  DNA-binding transcriptional activator TdcA  26.2 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>