More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5372 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4898  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2994  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5372  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0254  LysR family transcriptional regulator  95.42 
 
 		 306 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.56957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0207  LysR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 306 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7090  transcriptional regulator, LysR family  65.69 
 
 		 306 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4197  LysR family transcriptional regulator  64.05 
 
 		 310 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 300 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.43 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5134  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  0.868057 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5758  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0665563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4546  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3822  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2711  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2585  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5936  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.73 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0218  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4764  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 332 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5307  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 306 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0037216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.72 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.24 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3348  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0103811 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1495  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.24 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2110  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.24 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0793  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1807  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0377  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.24 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0229  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0475  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  28.24 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.24 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  28.24 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0296  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0957  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2219  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1940  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1663  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1244  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0206  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.91 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6670  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 311 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 316 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.33 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0146  transcriptional regulator, LysR family  29.59 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4846  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5423  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0829573  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5439  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2168  transcriptional regulator, LysR family  26.24 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4103  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0068  transcriptional regulator, LysR family  36.89 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1765  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1301  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.828365  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 316 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4446  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.553142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3555  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 302 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 331 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 316 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1450  transcriptional regulator, LysR family  26.33 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.756367  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1368  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 303 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1408  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0263821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6018  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4248  LysR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.409634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6318  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5754  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.41 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3176  transcriptional regulator, LysR family  25.71 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4768  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3599  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5515  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.664098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 351 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2599  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 319 aa  92.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7451  LysR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0947  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2915  transcriptional regulator, LysR family  25.61 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0114903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3205  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0988994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 309 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>