More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3565 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3565  DNA-binding transcriptional activator TdcA  100 
 
 		 312 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3540  DNA-binding transcriptional activator TdcA  80.45 
 
 		 312 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0279339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3507  DNA-binding transcriptional activator TdcA  80.45 
 
 		 312 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3433  DNA-binding transcriptional activator TdcA  80.45 
 
 		 312 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3603  DNA-binding transcriptional activator TdcA  80.13 
 
 		 312 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.835154 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3436  DNA-binding transcriptional activator TdcA  80.13 
 
 		 312 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.716587  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02985  DNA-binding transcriptional activator  80.91 
 
 		 312 aa  524  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0585  transcriptional regulator, LysR family  80.91 
 
 		 312 aa  524  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02936  hypothetical protein  80.91 
 
 		 312 aa  524  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3414  DNA-binding transcriptional activator TdcA  80.91 
 
 		 312 aa  524  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4431  DNA-binding transcriptional activator TdcA  80.91 
 
 		 312 aa  524  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0908114 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0580  DNA-binding transcriptional activator TdcA  80.91 
 
 		 312 aa  524  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3306  DNA-binding transcriptional activator TdcA  80.91 
 
 		 312 aa  524  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3592  DNA-binding transcriptional activator TdcA  80.91 
 
 		 312 aa  524  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3239  DNA-binding transcriptional activator TdcA  80.26 
 
 		 312 aa  521  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4446  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.553142  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.81 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.81 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.81 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  26.81 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.81 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.81 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.81 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.81 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4199  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.74 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  26.81 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.03 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.03 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1663  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 338 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0206  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0296  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2219  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1244  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1940  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3970  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0957  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4432  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4103  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0218  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1299  LysR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4546  LysR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.471439  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5758  LysR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0665563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3822  LysR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1826  LysR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  hitchhiker  0.00784297 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5134  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  0.868057 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6670  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128722  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0222  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3205  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0988994 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6604  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6318  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2585  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1518  transcriptional regulator, LysR family  23.4 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6018  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2711  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2168  transcriptional regulator, LysR family  26.89 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2956  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.2285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26270  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 		 329 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.338283  normal  0.903696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2599  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888741  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2910  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5141  LysR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.730925 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7090  transcriptional regulator, LysR family  28.84 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4171  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 305 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3344  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0604334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4822  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1495  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0603097  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2110  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0793  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1807  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0377  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  25.78 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0475  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  25.3 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0207  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3700  LysR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0546971  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5811  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5936  transcriptional regulator, LysR family  26.87 
 
 		 302 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4197  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3819  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.37605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0146  transcriptional regulator, LysR family  24.8 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  27.87 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  27.82 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  25.26 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7451  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 302 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1794  transcriptional regulator, LysR family  27.17 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 417 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3514  LysR family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 321 aa  89  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.17891  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3555  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 302 aa  89  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 419 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>