More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4388 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4388  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4525  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2148  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0402296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1982  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2377  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5754  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.98 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4014  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2771  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290913  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1368  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2281  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5761  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0241  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.27 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08140  Transcriptional regulator, LysR family  31.47 
 
 		 320 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54710  putative transcriptional regulator  32.06 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0282629  hitchhiker  0.000000212849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1431  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30963  normal  0.127714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4677  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 343 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0483253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4781  putative transcriptional regulator  32.4 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5250  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.23 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3549  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1472  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  0.120322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0212  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0270  putative transcriptional regulator  29.87 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02390  putative transcriptional regulator  29.53 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.125777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4431  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203311  normal  0.0207668 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2959  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24730  LysR family transcriptional regulator protein  31.02 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08180  Transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3429  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000037379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1434  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0215  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0141  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0882865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2634  transcriptional regulator, LysR family  33.5 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1834  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.202618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2622  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.342108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4326  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 309 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0234  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4542  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1355  transcriptional regulator, LysR family  28.76 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3174  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2844  LysR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5002  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  25.66 
 
 		 314 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  36.76 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  36.76 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 323 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 298 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5902  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  25.34 
 
 		 314 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3863  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  28.1 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5247  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  29.26 
 
 		 331 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5074  transcriptional regulator, LysR family  28.66 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.507053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27230  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0811  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4320  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.279054  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  31.25 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5002  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5858  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.845274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1831  transcriptional regulator, LysR family  31.68 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000621  transcriptional regulator  26.86 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3242  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.42821 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6795  transcriptional regulator, LysR family  30.37 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.775917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4443  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.917968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5092  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.478333 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5865  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 313 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813492  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2983  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1907  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 289 aa  85.9  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05499  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 298 aa  85.9  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  24.56 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  31.32 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0107  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.2 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  32.87 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2411  transcription regulator protein  33.8 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2186  LysR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.209379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4555  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.91 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1050  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4285  LysR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1033  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1007  fhu operon transcription regulator  28.06 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000456933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1720  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.0235109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>