230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4071 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 115 aa  230  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  79.8 
 
 		 115 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  68.7 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  60 
 
 		 107 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  49.56 
 
 		 123 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  49.56 
 
 		 123 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  48.21 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  48.21 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  45.92 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  46.94 
 
 		 119 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  45.22 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  38.94 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  49.53 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 162 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  51.19 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  39.81 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  45.35 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  43.53 
 
 		 263 aa  77.8  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  42.05 
 
 		 262 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 262 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  45.56 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  38.52 
 
 		 270 aa  74.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  45.45 
 
 		 265 aa  73.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  38.16 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  35.87 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  34 
 
 		 245 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  31.25 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  46.15 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  35.25 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  39.13 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  38.54 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  36.26 
 
 		 263 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  35.11 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  36.67 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  35.87 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  40.79 
 
 		 263 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 263 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  39.77 
 
 		 268 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  40 
 
 		 263 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  32.93 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  32.93 
 
 		 245 aa  62  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  43.21 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 268 aa  62  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  32.93 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  45.24 
 
 		 259 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  39.66 
 
 		 257 aa  61.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  39.42 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  39.08 
 
 		 270 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  40.23 
 
 		 281 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  39.42 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 269 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 263 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  40.66 
 
 		 269 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  34.88 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  37.36 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  32.63 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  41.24 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  31.11 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>