185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3855 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  233  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 116 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  56.78 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  59.43 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  59.43 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  55.67 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  52.63 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  52.75 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  58.43 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  55.56 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  55.56 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  47.57 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  58.51 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 162 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  61.04 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  52.53 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  40.21 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  51.02 
 
 		 265 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  50.65 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  42.86 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  46.34 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  40.22 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  44.3 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  39.18 
 
 		 270 aa  72  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  41.77 
 
 		 263 aa  70.9  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  39.58 
 
 		 263 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  38 
 
 		 268 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  48.15 
 
 		 257 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  63.33 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  36.46 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  46.99 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  44.79 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  34.52 
 
 		 263 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  36.96 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  35.48 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  31.87 
 
 		 245 aa  60.5  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  43.9 
 
 		 268 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  31.87 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  44.19 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  42.42 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  42.42 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  32.1 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  34.57 
 
 		 266 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  42.11 
 
 		 270 aa  57  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  43.59 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  27 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  34.44 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  43.9 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  24.18 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  42.31 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  42.31 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3016  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  40.79 
 
 		 370 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  37.5 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  32.93 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  34.88 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 236 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 279 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  44 
 
 		 252 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  44 
 
 		 252 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  43.16 
 
 		 270 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>