203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1131 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 125 aa  242  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  58.56 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  58.56 
 
 		 114 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  50 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  55.05 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  48.65 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  52.38 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  55.81 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  55.81 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  50.94 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  62.3 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  42.86 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  43.97 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  52.08 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  41.49 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  45.88 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  45.45 
 
 		 262 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 262 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  43.01 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  40.19 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  44.21 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  32.73 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  38.64 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  39.13 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  34.31 
 
 		 263 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  36.78 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  38.68 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  33.67 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  42.71 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  55.36 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 263 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  37.23 
 
 		 263 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  39.09 
 
 		 268 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  42.55 
 
 		 257 aa  60.5  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  30.28 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  30 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  41.33 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  40.38 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  56 
 
 		 265 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  56 
 
 		 265 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  45.68 
 
 		 269 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 269 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  37.38 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  36.45 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  34 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  28.26 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  45.45 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  38.46 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  34 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  34 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  43.43 
 
 		 263 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  36.45 
 
 		 281 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  51.06 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 270 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  44.32 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  31.82 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 259 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  36 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  38.83 
 
 		 267 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>