212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6170 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  275  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  57.01 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  47.52 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  47.22 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  53.27 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  47.22 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  49.52 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  48.51 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  48.45 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  48.45 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  44.76 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  59.55 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  53.68 
 
 		 177 aa  89.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  44.34 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  46.24 
 
 		 114 aa  84  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 112 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  52.81 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  48.84 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  40.91 
 
 		 262 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 262 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 117 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  36.96 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  47.3 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  50 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  39.78 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  39.24 
 
 		 263 aa  63.5  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 270 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  35.96 
 
 		 195 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 268 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  41.43 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 260 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  35.79 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  40.79 
 
 		 233 aa  60.5  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  40.79 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  40.79 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  36.36 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  35.87 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  42.05 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  43.3 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  46.55 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  43.3 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 254 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  35.8 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  42.86 
 
 		 252 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 259 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  44.09 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  40.45 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  40 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  42.86 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  40 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  39.47 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  32.5 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3194  ModE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.112161  hitchhiker  0.0000253797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  30.43 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0744  ModE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  38.38 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 279 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  40.45 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  29.63 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  47.62 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  45.76 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  38.1 
 
 		 269 aa  53.9  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>