102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2075 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  100 
 
 		 140 aa  281  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  59.48 
 
 		 134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  52 
 
 		 134 aa  133  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  45.9 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 162 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  37.84 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  37.84 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  40.78 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  38.1 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  40.22 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  39.81 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  40.22 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  33.04 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  43.14 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  48.89 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  44.59 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  34.88 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 262 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  38.64 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  36.05 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  33.72 
 
 		 270 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 261 aa  53.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 263 aa  52.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  36.11 
 
 		 263 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  34.88 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  34.72 
 
 		 263 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 263 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  30.47 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  33.93 
 
 		 366 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  34.94 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  36.84 
 
 		 266 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  39.81 
 
 		 265 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  39.81 
 
 		 265 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  26.37 
 
 		 260 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  47.22 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 263 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 263 aa  48.5  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  36.71 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  50.82 
 
 		 252 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 254 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  35.29 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  32.18 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  39.19 
 
 		 257 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  49.18 
 
 		 252 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  38.89 
 
 		 267 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  36.9 
 
 		 345 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3075  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  35.44 
 
 		 346 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 269 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 259 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  28.7 
 
 		 366 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  37.14 
 
 		 254 aa  42  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 259 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  40.91 
 
 		 263 aa  42  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 267 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  33.8 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  32.41 
 
 		 259 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  40.96 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  28.7 
 
 		 366 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  37.14 
 
 		 254 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0932  regulatory protein, LysR  29.63 
 
 		 365 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658319  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  29.85 
 
 		 195 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3016  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  30.77 
 
 		 370 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 254 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3194  ModE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 259 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.112161  hitchhiker  0.0000253797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 259 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0744  ModE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 259 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 254 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  27.27 
 
 		 369 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  40.82 
 
 		 269 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38.24 
 
 		 263 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 254 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>