225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5342 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  38.94 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  47.19 
 
 		 114 aa  85.9  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  41 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  42.11 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  35.78 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  44.95 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  39.09 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  39.09 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  47.06 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  38.3 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  40.43 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  41.98 
 
 		 263 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  35.35 
 
 		 247 aa  70.5  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  37.23 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 258 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  45 
 
 		 262 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  45 
 
 		 262 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  35.63 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  40 
 
 		 263 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  46.24 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  44.44 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  42 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  41 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  40.48 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  44.71 
 
 		 269 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  41.67 
 
 		 263 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  38.04 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  42.5 
 
 		 270 aa  63.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  38.64 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  38.64 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  38.64 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  40.54 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  44.58 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  40.54 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  35.79 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  43.33 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  43.53 
 
 		 270 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  43.53 
 
 		 270 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  33.68 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  43.37 
 
 		 270 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  42.5 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 		 236 aa  60.1  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 259 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 259 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  49.12 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  42.42 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  39.51 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  49.12 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  35 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  43.9 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  49.12 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  40 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  40.91 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  44.44 
 
 		 267 aa  57.4  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  43.96 
 
 		 254 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  40.45 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1461  molybdenum-binding protein  43.06 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  56.52 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  31.73 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>