207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1034 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  100 
 
 		 111 aa  226  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  49.51 
 
 		 257 aa  106  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  57.81 
 
 		 258 aa  89  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  47 
 
 		 265 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  47.17 
 
 		 270 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  47.17 
 
 		 270 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  47.57 
 
 		 269 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 268 aa  76.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  37.86 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  39.05 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  40.43 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  44.79 
 
 		 263 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  36.36 
 
 		 263 aa  73.6  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 290 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  39.05 
 
 		 269 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 276 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 269 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  49.23 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  37.96 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  36.54 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  47.69 
 
 		 263 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  41.77 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  35.24 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  41.77 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  41.18 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 278 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  37 
 
 		 269 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 259 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  49.23 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 269 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  36.89 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  40.24 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  40 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  32.41 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  43.24 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3194  ModE family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.112161  hitchhiker  0.0000253797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  44.59 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0744  ModE family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  39.25 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  39.02 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  33.64 
 
 		 281 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  46.84 
 
 		 263 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  41 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  43.01 
 
 		 267 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  44.59 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  33.64 
 
 		 270 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 268 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 267 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  38 
 
 		 262 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  38 
 
 		 262 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39 
 
 		 263 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  36.56 
 
 		 270 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  39 
 
 		 263 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  45.57 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  43.04 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  49.15 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  41.75 
 
 		 282 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  38.96 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3862  molybdenum transport regulatory protein ModE  39.22 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  33.98 
 
 		 195 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  42.25 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 276 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  37.25 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  38 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  40.45 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  40.45 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>