273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2172 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 131 aa  267  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  46.43 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  43.36 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  42.62 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  44.25 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  29.73 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  33.64 
 
 		 245 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  33.64 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  33.64 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  33.64 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  41.18 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  37.61 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  43.04 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  32.63 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  27.93 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  37.23 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  37.5 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  30.56 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2363  molybdate metabolism transcriptional regulator  48.39 
 
 		 368 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4147  molybdate metabolism transcriptional regulator  46.77 
 
 		 368 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.70321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  46.77 
 
 		 368 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  41.33 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  46.77 
 
 		 368 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  46.77 
 
 		 368 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0910  molybdate metabolism transcriptional regulator  46.77 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527444  normal  0.0178578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2967  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  36.89 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3016  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  51.56 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  40 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0898  molybdate metabolism transcriptional regulator  46.77 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3075  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  41.98 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  32.67 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  40.24 
 
 		 345 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0339  molybdate metabolism transcriptional regulator  44.64 
 
 		 358 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  39.36 
 
 		 369 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0386  molybdate metabolism transcriptional regulator  51.67 
 
 		 362 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  38.1 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  38.27 
 
 		 269 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 278 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 268 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0616  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.32 
 
 		 365 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588457  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  35.79 
 
 		 270 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2591  molybdate transport repressor  43.55 
 
 		 359 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0446  molybdate transport repressor  43.55 
 
 		 344 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  26.32 
 
 		 270 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 276 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3008  regulatory protein  43.55 
 
 		 344 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1625  molybdate transport repressor  43.55 
 
 		 368 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0184  molybdate transport repressor  43.55 
 
 		 359 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0963  molybdate transport repressor  43.55 
 
 		 359 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386261  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  37.35 
 
 		 263 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  31.39 
 
 		 278 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2898  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 359 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2960  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 359 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0932  regulatory protein, LysR  46.27 
 
 		 365 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658319  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 254 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 260 aa  51.6  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  44.44 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0967  molybdate metabolism transcriptional regulator  48.39 
 
 		 359 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  29.13 
 
 		 265 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3020  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  48.39 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475131  normal  0.0124041 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  30.36 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  44.78 
 
 		 366 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 254 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  44.78 
 
 		 366 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  44.78 
 
 		 366 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  34.57 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  34.57 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0730  molybdate metabolism transcriptional regulator  46.77 
 
 		 360 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.739883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  35 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 254 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  36.49 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  36 
 
 		 263 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  36.49 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  34.78 
 
 		 257 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  35.56 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>