178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1394 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  348  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  58.59 
 
 		 136 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  50.41 
 
 		 131 aa  121  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  53.1 
 
 		 139 aa  120  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  44.34 
 
 		 134 aa  96.3  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 125 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 123 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  38.18 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  37.93 
 
 		 195 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 125 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  34.86 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  36.45 
 
 		 114 aa  60.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  42.86 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  34.74 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  39.76 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  35.56 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  35.51 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  41.33 
 
 		 115 aa  57  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  39.53 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  30.84 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  36.78 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  38.64 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  37.63 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  29.91 
 
 		 247 aa  54.3  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  37.76 
 
 		 269 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  36.14 
 
 		 270 aa  52.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 118 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 269 aa  52  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  31.11 
 
 		 263 aa  51.6  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 112 aa  50.8  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  33.33 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  30.36 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  32.14 
 
 		 268 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0963  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.54 
 
 		 297 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.549295  hitchhiker  0.00109251 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  30.36 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  30.36 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 258 aa  49.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 268 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0045  molybdate metabolism transcriptional regulator  41.54 
 
 		 297 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  23.13 
 
 		 270 aa  48.5  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  35.23 
 
 		 263 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 270 aa  48.5  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2967  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  43.08 
 
 		 353 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  44.62 
 
 		 345 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 254 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  30.09 
 
 		 270 aa  48.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  35.87 
 
 		 114 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  35.87 
 
 		 114 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 120 aa  47.8  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  28.97 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3867  LysR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 309 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0459798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  36.67 
 
 		 257 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 276 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  30.77 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 254 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3075  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  44.62 
 
 		 346 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  32.58 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  48.98 
 
 		 366 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  29.17 
 
 		 281 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 115 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  34.18 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  48.98 
 
 		 366 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  46.94 
 
 		 366 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  24.49 
 
 		 269 aa  45.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  43.75 
 
 		 369 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  30.09 
 
 		 270 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  30.43 
 
 		 265 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0896  molybdate metabolism transcriptional regulator  44.9 
 
 		 365 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 323 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 323 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 254 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 323 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 263 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  34.88 
 
 		 254 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2438  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 324 aa  45.1  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  32.79 
 
 		 263 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  34 
 
 		 263 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 267 aa  44.7  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  34.94 
 
 		 266 aa  44.7  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0803  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 308 aa  44.3  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 128 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1822  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.46 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  37.21 
 
 		 270 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 279 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5807  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 315 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.540169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>