More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0803 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0803  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5246  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.2 
 
 		 311 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 327 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  35.76 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5106  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000185857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0011  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  34.63 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3810  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  34.28 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  32.56 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.23 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  30.33 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 295 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 294 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  34.64 
 
 		 312 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  31.89 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  33.11 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  32.01 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  31.56 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  32.9 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  31.56 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  32.15 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2237  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.909797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 303 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  31.65 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6198  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0517746 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3102  transcriptional regulator, LysR family  29.32 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43980  LysR family transcriptional regulatory protein  34 
 
 		 314 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3330  transcriptional regulator, LysR family  28.15 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>