More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5106 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5106  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  624  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000185857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5246  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  81.21 
 
 		 311 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0011  LysR family transcriptional regulator  48.49 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3810  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 372 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 303 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  41.36 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0803  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 308 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 		 296 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  36.88 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  35.91 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 304 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 303 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43980  LysR family transcriptional regulatory protein  40.65 
 
 		 314 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  38.31 
 
 		 297 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  37.87 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 304 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  37.5 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 304 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 330 aa  175  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3330  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2215  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 293 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 310 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>