92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0566 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0566  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 
114 aa  229  8.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.454266  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13050  molybdenum-binding protein  65.17 
 
 
115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.803513  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  53.04 
 
 
114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  44.25 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  39.39 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  38.14 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  37.63 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  28.83 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  38.61 
 
 
136 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  35.51 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  31.48 
 
 
116 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  34.45 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  39 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  37.63 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  37.78 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  38.2 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  40.45 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  32.08 
 
 
242 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 
236 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0932  regulatory protein, LysR  36.47 
 
 
365 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658319  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 
118 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  31.96 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  36.47 
 
 
366 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  36.17 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  30.56 
 
 
125 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  32.69 
 
 
123 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  32.69 
 
 
123 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  35.29 
 
 
366 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  35.29 
 
 
366 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  33.73 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  34.02 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  32.17 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0658  putative transcriptional regulator, ModE family  36.7 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  35.87 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  34.58 
 
 
139 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  30.48 
 
 
152 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  31.82 
 
 
265 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
115 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  28.28 
 
 
245 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  38.03 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  35.64 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  28.97 
 
 
233 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  28.97 
 
 
245 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  32.65 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  37.66 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  30.48 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  35.59 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6198  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
297 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0517746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
128 aa  42.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2722  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
295 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.771142  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6414  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
296 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.773226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  30.53 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
301 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  29.25 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1508  molybdate metabolism transcriptional regulator  30.63 
 
 
375 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  29.25 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 
322 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  28.04 
 
 
233 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0896  molybdate metabolism transcriptional regulator  36.62 
 
 
365 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 
322 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  37.18 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  30.21 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3020  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  26.67 
 
 
359 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475131  normal  0.0124041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  32.91 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0963  molybdate metabolism transcriptional regulator  33.87 
 
 
297 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.549295  hitchhiker  0.00109251 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 
263 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  30.77 
 
 
115 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0276  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
571 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1577  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  34.52 
 
 
369 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0932  transcriptional regulator  40 
 
 
303 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
294 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  30.38 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4390  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
293 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  28.24 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2363  molybdate metabolism transcriptional regulator  31.25 
 
 
368 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  28.89 
 
 
276 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0967  molybdate metabolism transcriptional regulator  28.87 
 
 
359 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930984  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2157  transcriptional regulator  43.1 
 
 
296 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.623501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  31.03 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  35.53 
 
 
195 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6343  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 
300 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0910  molybdate metabolism transcriptional regulator  30 
 
 
368 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527444  normal  0.0178578 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0045  molybdate metabolism transcriptional regulator  33.87 
 
 
297 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0898  molybdate metabolism transcriptional regulator  30 
 
 
368 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
339 aa  40.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3016  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  33.33 
 
 
370 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3578  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
317 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  37.25 
 
 
120 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  30.12 
 
 
126 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  31.33 
 
 
125 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>