More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2722 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2722  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.771142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0333  LysR family transcriptional regulator  54.58 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0952  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3551  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3426  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 299 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3354  transcriptional regulator, LysR family  47.77 
 
 		 299 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002880  putative transcriptional regulator LysR family  35.19 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0567  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0502789  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03092  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1081  transcriptional regulator AphB  33.45 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3921  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1178  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3007  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0670  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1001  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1106  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.399323 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  30.24 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3151  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 299 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00557033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3680  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3460  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3149  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3294  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132651  decreased coverage  0.000105765 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1220  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.482697  normal  0.0451908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2482  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1106  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1172  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0080  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3512  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04988  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1855  transcriptional regulator, LysR family protein  32.19 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2674  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4531  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001199  transcriptional regulator  30.64 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.862431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  31.08 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2769  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.937376  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5481  transcriptional regulator LysR family  31.21 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0288918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3342  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1967  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 297 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.19 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2916  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  29.57 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2865  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0938  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2824  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3906  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0765  LysR, substrate-binding  30.27 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.960601  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5708  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0328059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5151  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4977  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0806  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 310 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3120  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 330 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.540342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6245  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.41 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  27.8 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0611  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0549  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0269293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0830  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.588944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6097  transcriptional regulator, LysR family  30.43 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.867989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1149  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.181713  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0776  transcriptional regulator, LysR family protein  30.99 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2880  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.957922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2088  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.320314  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2190  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0283977  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  29.59 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3325  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1129  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2532  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4166  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2366  transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2760  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>