More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0567 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0567  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  624  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002880  putative transcriptional regulator LysR family  81.44 
 
 		 291 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03092  transcriptional regulator  80.41 
 
 		 291 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1081  transcriptional regulator AphB  69.82 
 
 		 291 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3354  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3426  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3551  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4517  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.408069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0952  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102057  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4649  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.0278568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1967  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0333  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3182  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795153  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2722  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.771142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3680  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0670  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  34.3 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1178  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867887  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1940  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  34.15 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3048  helix-turn-helix, Fis-type  31.96 
 
 		 303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0203224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3921  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3007  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1672  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1033  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0551  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 297 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 298 aa  162  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000421  transcriptional regulator  31.06 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.423035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0830  transcriptional regulator, LysR family  31.16 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.588944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6890  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4164  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0747  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  31.41 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.796071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  31.36 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 298 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1028  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 313 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 313 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 313 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  32.64 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3610  hypothetical protein  32.29 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0522  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.58 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0091  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000935  LysR-family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0375861  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  30.45 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3549  LyrR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  31.05 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 313 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  31.38 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 313 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4851  transcriptional regulator, LysR family  28.97 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204914  normal  0.243062 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3529  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  32.28 
 
 		 298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  31.25 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5239  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  32.29 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 399 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5256  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 359 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>