More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1564 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 343 aa  705    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1475  LysR family transcriptional regulator  54.18 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6125  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.7 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479061  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  40.91 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  38.99 
 
 		 335 aa  205  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 289 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  39.45 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 292 aa  202  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 304 aa  202  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2532  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  38.97 
 
 		 289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 306 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  38.97 
 
 		 289 aa  199  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1405  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  38.75 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 304 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  39.1 
 
 		 289 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1392  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000534606  normal  0.185395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2027  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3143  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937784  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4471  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190503  normal  0.801309 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4009  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 311 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  35.89 
 
 		 318 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4582  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 303 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00622026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 334 aa  196  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 301 aa  196  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3786  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 303 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5723  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 303 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210573 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  39.51 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1262  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3304  transcriptional regulator, LysR family  39.08 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406781  hitchhiker  0.00949003 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4614  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0515888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  39.51 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2119  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 317 aa  193  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3814  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.412952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  38.13 
 
 		 317 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1948  LysR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0632109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 334 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1294  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  35.31 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  35.31 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 302 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4656  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3707  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381625  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 293 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6067  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 294 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2097  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2240  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 305 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 298 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5774  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0474  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.471013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5388  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>