More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3371 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  93.41 
 
 
334 aa  651    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  93.41 
 
 
334 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  93.41 
 
 
334 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  97.01 
 
 
334 aa  668    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  94.91 
 
 
334 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  92.81 
 
 
334 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  93.41 
 
 
334 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
334 aa  686    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  94.91 
 
 
334 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  95.21 
 
 
334 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  93.41 
 
 
334 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  93.41 
 
 
334 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  95.21 
 
 
334 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  97.01 
 
 
334 aa  668    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  86.83 
 
 
334 aa  614  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  86.53 
 
 
334 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  84.43 
 
 
334 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  65.61 
 
 
428 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  65.61 
 
 
415 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  65.61 
 
 
435 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  67.22 
 
 
324 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  63.89 
 
 
338 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  67.55 
 
 
324 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  64.2 
 
 
324 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  67.55 
 
 
324 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  66.23 
 
 
324 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 
323 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  64.04 
 
 
323 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  63.47 
 
 
324 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  66.89 
 
 
322 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  63.34 
 
 
335 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  59.28 
 
 
342 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  60.4 
 
 
314 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  60.4 
 
 
314 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  60 
 
 
315 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  58.33 
 
 
299 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  53.21 
 
 
319 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  53.87 
 
 
318 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  53.2 
 
 
318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  55.22 
 
 
298 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 
304 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  52.35 
 
 
308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
303 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  54.73 
 
 
303 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  51.68 
 
 
313 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  52.04 
 
 
298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  50.67 
 
 
305 aa  318  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
305 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  51 
 
 
303 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 
305 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 
300 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  49.68 
 
 
313 aa  316  4e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  48.18 
 
 
305 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  45.87 
 
 
305 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  47.85 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  47.85 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  52.23 
 
 
299 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 
303 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 
303 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 
303 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  51.34 
 
 
301 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  52.23 
 
 
299 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
299 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
299 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  50.85 
 
 
305 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
327 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  46.2 
 
 
305 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 
303 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
299 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 
303 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
299 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 
309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 
305 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
303 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  49.66 
 
 
297 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  50.83 
 
 
303 aa  299  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2402  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 
372 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  49.19 
 
 
340 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
303 aa  298  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 
297 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  46.93 
 
 
309 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  48.68 
 
 
304 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  47.04 
 
 
300 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
304 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  48.3 
 
 
299 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  45.24 
 
 
295 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  48.14 
 
 
303 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  47.96 
 
 
300 aa  293  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  48.62 
 
 
314 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
300 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  46.78 
 
 
303 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0255  LysR family transcriptional regulator  47.8 
 
 
335 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1685  LysR family transcriptional regulator  47.8 
 
 
335 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256836  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3814  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
334 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.412952 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
300 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1773  LysR family transcriptional regulator  47.8 
 
 
335 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.790633  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
300 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0322  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 
305 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.844631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>