More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2402 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2402  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 372 aa  731    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4656  LysR family transcriptional regulator  87.26 
 
 		 334 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3707  LysR family transcriptional regulator  87.26 
 
 		 334 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381625  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3814  LysR family transcriptional regulator  86.94 
 
 		 334 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.412952 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5027  LysR family transcriptional regulator  84.07 
 
 		 358 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  59.47 
 
 		 318 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  58.47 
 
 		 318 aa  352  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  57.1 
 
 		 319 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 334 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 334 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 334 aa  299  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 334 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 334 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 334 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 334 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 334 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 334 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 334 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 324 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 334 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 334 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  49.14 
 
 		 334 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 415 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 335 aa  279  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  44.61 
 
 		 435 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 324 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 324 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 324 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 323 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 324 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 322 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 342 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  46.58 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  46.58 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  45.21 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0784  LysR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 298 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  46.05 
 
 		 299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 303 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 303 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 303 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 305 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  40.8 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  40.8 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  40.8 
 
 		 302 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 304 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 300 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 300 aa  242  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 300 aa  242  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 305 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 303 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  41.58 
 
 		 295 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 303 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 304 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  41.69 
 
 		 300 aa  232  9e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 298 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 304 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  41.89 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  44.18 
 
 		 297 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 297 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  44.59 
 
 		 304 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 		 305 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 309 aa  225  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 303 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0343  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0994  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 292 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0615  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 301 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  43.15 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  41.87 
 
 		 305 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  42.39 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 299 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>