More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0800 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 334 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 334 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 334 aa  331  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 334 aa  331  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 334 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 334 aa  325  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 334 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 334 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 334 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 334 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 334 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 334 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 334 aa  322  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 334 aa  322  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 338 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 324 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 324 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 324 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 342 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 323 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  47.14 
 
 		 435 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 415 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 428 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 324 aa  295  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 322 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  45.24 
 
 		 315 aa  288  6e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 304 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 319 aa  278  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  45.3 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 		 301 aa  265  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 340 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 297 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  42.71 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  42.71 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 305 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  42.71 
 
 		 302 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 305 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3618  transcriptional regulator, LysR family  43.24 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 303 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 303 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 303 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 300 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 300 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 300 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.33 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  43.69 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 303 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3807  transcriptional regulator, LysR family  42 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.832757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 309 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.8 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.866328  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1801  regulatory protein LysR  40.47 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0384326  normal  0.0215354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  41.5 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1802  regulatory protein LysR:LysR, substrate-binding  40.07 
 
 		 301 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.450792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 303 aa  248  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1655  regulatory protein LysR:LysR, substrate-binding  40.47 
 
 		 301 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1863  regulatory protein LysR  39.8 
 
 		 301 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  42.18 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 303 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 308 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0255  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1685  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256836  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1773  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.790633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0323  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 351 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1103  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 351 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0101  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 351 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1270  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 351 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.436877  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 299 aa  239  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 303 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>