More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2277 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  90.91 
 
 		 297 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  68.46 
 
 		 314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  60.07 
 
 		 299 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  60.07 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2295  LysR family transcriptional regulator  62.01 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126851 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  60.07 
 
 		 299 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 299 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  60.07 
 
 		 299 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1035  transcriptional regulator, LysR family  60.54 
 
 		 303 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  59.4 
 
 		 299 aa  362  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 316 aa  361  6e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  59.4 
 
 		 299 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0812  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 309 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  58.05 
 
 		 300 aa  354  7.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1410  LysR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 301 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  normal  0.531112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5815  LysR family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 311 aa  345  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3062  LysR family transcriptional regulator  53.22 
 
 		 300 aa  338  7e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2508  LysR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2483  LysR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1872  LysR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2532  LysR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2403  LysR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121442  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  53.02 
 
 		 301 aa  326  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 334 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  53.4 
 
 		 314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  53.4 
 
 		 314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  52.04 
 
 		 315 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  52.19 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 299 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  48.98 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  51.02 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 		 308 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 334 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 334 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 334 aa  300  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 303 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 299 aa  298  7e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 334 aa  298  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 334 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 334 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 334 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 334 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 334 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 334 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 334 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 303 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 303 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 303 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 303 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  47.59 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4263  LysR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 305 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 		 305 aa  285  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  46.1 
 
 		 303 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0158  LysR family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 305 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  46.26 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  46 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0591  transcriptional regulator, LysR family  48.98 
 
 		 297 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 298 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3774  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 305 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 342 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0248  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 305 aa  278  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000146756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 335 aa  276  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0322  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0247  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 324 aa  275  9e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0249  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 307 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0910  LysR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0065  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0246  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0246  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  46.76 
 
 		 303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 304 aa  271  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0269  LysR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 337 aa  268  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2691  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.993609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 313 aa  266  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.1 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 428 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 415 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  44.56 
 
 		 435 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>