More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4927 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  97.48 
 
 		 318 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 318 aa  653    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  79.81 
 
 		 319 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 334 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  55.56 
 
 		 334 aa  361  9e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2402  LysR family transcriptional regulator  58.47 
 
 		 372 aa  352  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 334 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 334 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 338 aa  348  6e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  53.87 
 
 		 334 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 334 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 334 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 334 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 334 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3707  LysR family transcriptional regulator  56.54 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381625  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4656  LysR family transcriptional regulator  56.54 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3814  LysR family transcriptional regulator  56.21 
 
 		 334 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.412952 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5027  LysR family transcriptional regulator  59.23 
 
 		 358 aa  341  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 335 aa  341  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  52.17 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  51.86 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  50.84 
 
 		 314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  50.84 
 
 		 314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 415 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  49.83 
 
 		 435 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 428 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 324 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0784  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 301 aa  288  9e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  47 
 
 		 299 aa  281  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 313 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  47.37 
 
 		 304 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 300 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 299 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  42.19 
 
 		 302 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 302 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  42.52 
 
 		 302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 308 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 303 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 297 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5481  transcriptional regulator LysR family  41.61 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0288918  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 305 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  42.9 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 305 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  43.14 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 305 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  41.16 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 340 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2880  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.957922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  44.75 
 
 		 304 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  42.32 
 
 		 305 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 305 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 297 aa  255  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0322  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0674  transcriptional regulator, LysR family  41.41 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>