More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2592 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  616  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  54.03 
 
 
299 aa  350  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  54.7 
 
 
306 aa  344  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  53.33 
 
 
305 aa  334  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  53.85 
 
 
308 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  53.85 
 
 
308 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0158  LysR family transcriptional regulator  53 
 
 
305 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0910  LysR family transcriptional regulator  55.18 
 
 
306 aa  329  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3774  LysR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
305 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0247  LysR family transcriptional regulator  51.33 
 
 
305 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112344 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0248  LysR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
305 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000146756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  51.68 
 
 
298 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0249  LysR family transcriptional regulator  51.64 
 
 
307 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0246  LysR family transcriptional regulator  50.99 
 
 
307 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4263  LysR family transcriptional regulator  51.38 
 
 
305 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0246  LysR family transcriptional regulator  50.66 
 
 
307 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  52.07 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4884  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 
323 aa  310  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0225  LysR family transcriptional regulator  51.15 
 
 
318 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  51.72 
 
 
297 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3724  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 
299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0196  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 
323 aa  306  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00725264  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1053  transcriptional regulator, LysR family  50.68 
 
 
350 aa  305  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0192  transcriptional regulator, LysR family  49.33 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00370457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4009  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 
299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3825  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 
323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.18343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3926  transcriptional regulator, LysR family  48.99 
 
 
299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03369  predicted DNA-binding transcriptional regulator  48.99 
 
 
323 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00202868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03322  hypothetical protein  48.99 
 
 
323 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3814  LysR substrate binding domain protein  48.99 
 
 
300 aa  301  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3801  LysR substrate binding domain protein  48.31 
 
 
300 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0591  transcriptional regulator, LysR family  48.48 
 
 
297 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3982  LysR substrate binding domain-containing protein  48.31 
 
 
300 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.324102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3879  LysR substrate binding domain protein  48.31 
 
 
300 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3923  LysR substrate binding domain-containing protein  48.31 
 
 
300 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 
299 aa  295  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 
299 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 
299 aa  295  9e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 
327 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 
299 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 
299 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0269  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 
337 aa  292  5e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 
303 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
303 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
303 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 
303 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  46.9 
 
 
314 aa  289  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 
303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
299 aa  288  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 
303 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3356  transcriptional regulator, LysR family  48.14 
 
 
313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0455  LysR family transcriptional regulator  46 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4520  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 
301 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal  0.633071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0919  transcriptional regulator, LysR family protein  45.27 
 
 
307 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
334 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
334 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 
334 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  44.63 
 
 
300 aa  276  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4062  LysR family transcriptional regulator  47.33 
 
 
301 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0198165  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 
334 aa  275  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 
316 aa  275  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  46.98 
 
 
303 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 
334 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 
334 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 
309 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
334 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
334 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
334 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
334 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
334 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
334 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  43.43 
 
 
315 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1035  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 
303 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693724  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 
334 aa  269  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6056  LysR family transcriptional regulator  46.33 
 
 
301 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18637  normal  0.867565 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5692  LysR family transcriptional regulator  46.33 
 
 
301 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6541  LysR family transcriptional regulator  46.33 
 
 
301 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95038  normal  0.402814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1410  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
301 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  normal  0.531112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  43.49 
 
 
334 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
305 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 
314 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 
314 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
334 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
305 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0812  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 
309 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108647  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2295  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
314 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126851 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 
300 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 
303 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 
301 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  44.18 
 
 
305 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
338 aa  258  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  45.58 
 
 
300 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.84 
 
 
305 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3062  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 
300 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 
335 aa  255  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.624531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>