More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2577 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  99.38 
 
 		 323 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  92.9 
 
 		 324 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  92.9 
 
 		 324 aa  624  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  92.9 
 
 		 324 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  91.98 
 
 		 324 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  87.35 
 
 		 322 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  84.26 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  84.26 
 
 		 435 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  84.26 
 
 		 415 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  83.95 
 
 		 324 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 324 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 334 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  67.22 
 
 		 334 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  67.22 
 
 		 334 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  67.22 
 
 		 334 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  67.22 
 
 		 334 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  67.88 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  67.22 
 
 		 334 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  67.22 
 
 		 334 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  66.89 
 
 		 334 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 334 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  66.89 
 
 		 334 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  63.44 
 
 		 334 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 334 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  66.56 
 
 		 334 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 334 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  65.56 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 334 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 335 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  59.93 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 342 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  52.12 
 
 		 314 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  52.12 
 
 		 314 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  51 
 
 		 315 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  51.35 
 
 		 318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 319 aa  318  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 299 aa  318  7.999999999999999e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 305 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 303 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 298 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 305 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 304 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  46.98 
 
 		 301 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 298 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  48.64 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  47.68 
 
 		 304 aa  289  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 327 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 299 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 308 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  46.46 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 299 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 303 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  46.13 
 
 		 305 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 303 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 303 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 303 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  44.56 
 
 		 295 aa  279  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 303 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  47.12 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  47.12 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2402  LysR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 372 aa  276  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  44.41 
 
 		 302 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 301 aa  275  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  44.41 
 
 		 302 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  44.41 
 
 		 302 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  45.05 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  45.08 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  44.93 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 316 aa  272  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 303 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  43 
 
 		 305 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 340 aa  271  7e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 303 aa  271  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0343  LysR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 301 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>