More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2532 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  69.8 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  68.46 
 
 		 297 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1035  transcriptional regulator, LysR family  63.42 
 
 		 303 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  60.74 
 
 		 299 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  60.74 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  60.74 
 
 		 299 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  60.74 
 
 		 299 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  60.07 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  60.07 
 
 		 299 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 299 aa  360  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 316 aa  352  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  58.72 
 
 		 300 aa  351  8.999999999999999e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  58.16 
 
 		 309 aa  349  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2295  LysR family transcriptional regulator  59.22 
 
 		 314 aa  347  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3062  LysR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  56.04 
 
 		 301 aa  335  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0812  LysR family transcriptional regulator  57.86 
 
 		 309 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1410  LysR family transcriptional regulator  56.27 
 
 		 301 aa  332  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  normal  0.531112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5815  LysR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2508  LysR family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 309 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2483  LysR family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 309 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233033  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  51.86 
 
 		 315 aa  317  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  50.97 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  50.97 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1872  LysR family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2532  LysR family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2403  LysR family transcriptional regulator  57.65 
 
 		 309 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121442  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 334 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 334 aa  295  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 334 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  50.17 
 
 		 306 aa  295  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 334 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 334 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 334 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  47.87 
 
 		 308 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  47.96 
 
 		 334 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 334 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 334 aa  292  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 324 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  48.16 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4263  LysR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 305 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 298 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 323 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 334 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 303 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 303 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  48.03 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0158  LysR family transcriptional regulator  48.49 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0249  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0246  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 307 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0246  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 307 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3774  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 342 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0248  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 305 aa  275  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000146756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0247  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0910  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 324 aa  272  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0455  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3814  LysR substrate binding domain protein  47.83 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3724  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0196  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00725264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3801  LysR substrate binding domain protein  47.49 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4884  transcriptional regulator, LysR family  43.81 
 
 		 323 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3923  LysR substrate binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 300 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3879  LysR substrate binding domain protein  47.83 
 
 		 300 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3926  transcriptional regulator, LysR family  43.81 
 
 		 299 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  44.59 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3982  LysR substrate binding domain-containing protein  47.77 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.324102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  44.59 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4009  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03369  predicted DNA-binding transcriptional regulator  43.48 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00202868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0192  transcriptional regulator, LysR family  43.48 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00370457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 428 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 415 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0225  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  43.77 
 
 		 435 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>